В Империи больше достоинств, потому что там на страткарте почти весь земной шар, и там, где нет провинций, там есть фактории. Соответственно, колониальные войны, торговые войны, пиратство - всё это очень интересно.
Ещё в Империи очень хорошо реализовано развитие технологий, ты как бы чувствуешь, что армия становится сильнее, появляются новые отряды, новые возможности для пехоты и артиллерии, новые формации для полков, и тактика постоянно развивается, заставляя использовать новые отряды. В Наполеоне сразу всё доступно, стоит только построить соответствующие здания и вот сразу егеря и гренадеры. Плюс Империя сделана на рубеже веков, и там есть как отряды в треуголках и чулках, так и старорежимные стрельцы, хаккапелиты в морионах и кирасах и крылатые гусары. И, конечно же, великолепно проработанные индейцы в аддоне.
Но у Наполеона есть мощное достоинство - историчность формы. Если в Империи все сделаны по образцу англичан, меняются только цвета, то в Наполеоне каждая страна, иди даже чуть ли не каждый отряд имеет свою форму, причём хорошо отрисованную (а не с небритыми рожами алкоголиков, как конница в Империи). Ну и звук там лучше, настоящие выстрелы.